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Enregistrement W2060589610 · doi:10.1139/w04-079

Low genetic diversity among<i>Frankia</i>spp. strains nodulating sympatric populations of actinorhizal species of Rosaceae,<i>Ceanothus</i>(Rhamnaceae) and<i>Datisca glomerata</i>(Datiscaceae) west of the Sierra Nevada (California)

2004· article· en· W2060589610 sur OpenAlexvenueno aff
Brian D. Vanden Heuvel, David R. Benson, Esteban Bortiri, Daniel Potter

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésFrankiaBiologyActinorhizal plantBotanyRhamnaceaeGenetic diversityRoot noduleSymbiosisGeneticsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Frankia spp. strains typically induce N2-fixing root nodules on actinorhizal plants. The majority of host plant taxa associated with the uncultured Group 1 Frankia strains, i.e., Ceanothus of the Rhamnaceae, Datisca glomerata (Datiscaceae), and all actinorhizal members of the Rosaceae except Dryas, are found in California. A study was conducted to determine the distribution of Frankia strains among root nodules collected from both sympatric and solitary stands of hosts. Three DNA regions were examined, the 5' end of the 16S rRNA gene, the internal transcribed spacer region between the 16S and 23S rRNA genes, and a portion of the glutamine synthetase gene (glnA). The results suggest that a narrow range of Group 1 Frankia spp. strains dominate in root nodules collected over a large area of California west of the Sierra Nevada crest with no apparent host-specificity. Comparisons with Group 2 Frankia strain diversity from Alnus and Myrica within the study range suggest that the observed low diversity is peculiar to Group 1 Frankia strains only. Factors that may account for the observed lack of genetic variability and host specificity include strain dominance over a large geographical area, current environmental selection, and (or) a past evolutionary bottleneck.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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