MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2060621346 · doi:10.1074/jbc.275.5.3431

Identification of CD7 as a Cognate of the Human K12 (SECTM1) Protein

2000· article· en· W2060621346 sur OpenAlexaff
Stewart D. Lyman, Sydney M. Escobar, Anne-Marie Rousseau, Allison J. Armstrong, William C. Fanslow

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensResearch & Development Corporation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCognateIdentification (biology)Computational biologyBiologyChemistryLinguisticsEcologyPhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CD7 is a 40-kDa protein found primarily on T, NK, and pre-B cells; the function of the CD7 protein in the immune system is largely unknown. The K12 (SECTM1) protein was originally identified by its location just upstream of the CD7 locus. The K12 gene encodes a transmembrane protein of unknown function. In order to clone a K12-binding protein, we generated a soluble version of the human K12 protein by fusing its extracellular domain to the Fc portion of human IgG(1). Flow cytometry experiments showed that the K12-Fc fusion protein bound at high levels to both human T and NK cells. Precipitation experiments using K12-Fc on (35)S-radiolabeled NK cells lysates indicated that the K12 cognate was an approximately 40-kDa protein. A human peripheral blood T cell cDNA expression library was screened with the K12-Fc protein, and two independent, positive cDNA clones were identified and sequenced. Both cDNAs encoded the same protein, which was CD7. Thus, K12 and CD7 are cognate proteins that are located next to each other on human chromosome 17q25. Additionally, we have cloned the gene encoding the mouse homologue of K12, shown that it maps near the mouse CD7 gene on chromosome 11, and established that the mouse K12 protein binds to mouse, but not human, CD7. Mouse K12-Fc inhibited in a dose-dependent manner concanavalin A-induced proliferation, but not anti-TcRalpha/beta induced proliferation, of mouse lymph node T cells. Human K12-Fc stimulated the up-regulation of CD25, CD54, and CD69 on human NK cells in vitro.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetMonoclonal and Polyclonal Antibodies ResearchTravaux en français237 207