Time-resolved quantitative proteomics implicates the core snRNP protein, SmB, together with the Survival of Motor Neuron protein, in neural trafficking
Notice bibliographique
Résumé
The biogenesis of splicing snRNPs (small nuclear ribonucleoproteins) is a complex process, beginning and ending in the nucleus of the cell but including key stages that take place in the cytoplasm. In particular, the SMN (survival motor neuron) protein complex is required for addition of the core Sm proteins to the snRNP. Insufficiency of SMN results in the inherited neurodegenerative condition, spinal muscular atrophy (SMA). Details of the physical organization of the cytoplasmic stages of snRNP biogenesis are unknown. Here, we use time-resolved quantitative proteomics to identify proteins that associate preferentially with either newly assembled or mature splicing snRNPs. We identified highly mobile SmB protein-trafficking vesicles in neural cells, which are dependent on the cellular levels of SMN and SmB for their morphology and mobility. We propose that these represent a family of related vesicles, some of which play a role in snRNP biogenesis and some that might play more diverse roles in cellular RNA metabolism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».