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Enregistrement W2060718588 · doi:10.1107/s1744309112017939

Structure of a short-chain dehydrogenase/reductase from<i>Bacillus anthracis</i>

2012· article· en· W2060718588 sur OpenAlexaff
Jing Hou, Kamila Wojciechowska, Heping Zheng, M. Chruszcz, David R. Cooper, M. Cymborowski, T. Skarina, Elena Gordon, Alexei Savchenko, W. Minor

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section F Structural Biology and Crystallization Communications · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesArgonne National LaboratoryNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesBiological and Environmental ResearchNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesU.S. Department of Energy
Mots-clésBacillus anthracisReductaseMicrobiologyChemistryBiochemistryEnzymeBiologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The crystal structure of a short-chain dehydrogenase/reductase from Bacillus anthracis strain `Ames Ancestor' complexed with NADP has been determined and refined to 1.87 Å resolution. The structure of the enzyme consists of a Rossmann fold composed of seven parallel β-strands sandwiched by three α-helices on each side. An NADP molecule from an endogenous source is bound in the conserved binding pocket in the syn conformation. The loop region responsible for binding another substrate forms two perpendicular short helices connected by a sharp turn.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,364
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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