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Enregistrement W2060889734 · doi:10.1016/j.matbio.2011.03.002

Collagen VI is a basement membrane component that regulates epithelial cell–fibronectin interactions

2011· article· en· W2060889734 sur OpenAlexafffund
Jean‐François Groulx, David Gagné, Yannick D. Benoit, Denis Martel, Nùria Basora, Jean‐François Beaulieu

Notice bibliographique

RevueMatrix Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNational Institute of Environmental Health SciencesCanadian Institutes of Health ResearchChinese Academy of Agricultural SciencesCanada Research ChairsNational Institutes of HealthUniversité de Sherbrooke
Mots-clésFibronectinCell biologyBasement membraneCollagen VIChemistryBasal laminaExtracellular matrixCollagen, type I, alpha 1Myosin light-chain kinaseType I collagenCollagen receptorCell adhesionFocal adhesionType IV collagenPhosphorylationCellBiologyLamininBiochemistryAnatomyUltrastructureEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Collagen VI is a heterotrimer composed of three α chains (α1, α2, α3) widely expressed throughout various interstitial matrices. Collagen VI is also found near the basement membranes of many tissues where it serves as an anchoring meshwork. The aim of this study was to investigate the distribution and role of collagen VI at the epithelial-stromal interface in the intestine. Results showed that collagen VI is a bona fide epithelial basal lamina component and constitutes the major collagen type of epithelial origin in this organ. In vitro, collagen VI co-distributes with fibronectin. Targeted knockdown of collagen VI expression in intestinal epithelial cells was used to investigate its function. Depletion of collagen VI from the matrix led to a significant increase in cell spreading and fibrillar adhesion formation coinciding with an upregulation of fibronectin expression, deposition and organization as well as activation of myosin light chain phosphorylation by the myosin light chain kinase and Rho kinase dependent mechanisms. Plating cells deficient for collagen VI on collagen VI rescued the phenotype. Taken together, these data demonstrate that collagen VI is an important basal lamina component involved in the regulation of epithelial cell behavior most notably as a regulator of epithelial cell-fibronectin interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations129
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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