MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2060964779 · doi:10.1094/pdis-94-8-0977

Identification of the Phytoplasma Associated with Wheat Blue Dwarf Disease in China

2010· article· en· W2060964779 sur OpenAlexafffund
Yunfeng Wu, Xingan Hao, Zhengnan Li, Peiwen Gu, Fengqui An, Jianye Xiang, Haini Wang, Zhaopeng Luo, Yu Xiang

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytoplasmas and Hemiptera pathogens
Établissements canadiensCanadian Sport Centre PacificNatural Resources CanadaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaHigher Education Discipline Innovation ProjectNorthwest A and F University
Mots-clésPhytoplasmaBiology16S ribosomal RNAGeneticsAster yellowsRibosomal RNAPrimer (cosmetics)GeneNucleic acid sequencePhylogenetic treePolymerase chain reactionBotanyRestriction fragment length polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wheat blue dwarf disease (WBD) was first reported in China in the 1960s. It has caused severe losses on several occasions in winter wheat (Triticum aestivum) in northwestern China, and the nature of the pathogenic agent has been unknown. Here we have shown that WBD was caused by a 16SrI-C phytoplasma transmitted by Psammotettix striatus. This finding was based on molecular diagnostics, insect transmission trials, and host-range determination. Portions of the 16S rRNA and ribosomal protein (rp) genes, rpsS (rps19), rplV (rpl22), and rpsC (rps3), were amplified from DNA samples of WBD-infected wheat seedlings by polymerase chain reaction (PCR) utilizing phytoplasma specific primer pairs. The nucleotide sequences of these amplicons showed high identity to these genes from phytoplasma strains in the aster yellows group (16SrI). Pairwise nucleotide sequence identities of WBD 16S rDNA compared to representative genes of 16SrI group strains ranged from 98.9 to 99.9%, whereas compared to 17 other phytoplasma groups (16SrII to 16SrXVIII), sequence identity ranged from 88.6 to 96.0%. Similarly, the sequence identities of rps19, rpl22, and rps3 between WBD and 16SrI group strains varied from 96.6 to 99.7%, but only 60.3 to 65% between WBD and other phytoplasma groups. Phylogenetic analyses were carried out on sequences from 16S rRNA and ribosomal protein genes (rps19, rpl22, and rps3), respectively, and both results indicated that WBD phytoplasma was a member of the 16SrI group and most closely related to subgroup 16SrI-C. WBD-infected P. striatus were present in wheat fields with WBD, and phytoplasma infection was verified by PCR detection followed by DNA sequencing. Insect transmission trials confirmed that P. striatus transmitted the WBD phytoplasmal agent from infected wheat to healthy wheat seedlings and seven other different plant species in the greenhouse. A survey of various weed species near WBD-infected wheat fields found 10 plant species in seven families to be positive for the presence of WBD phytoplasma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePlant DiseaseMême sujetPhytoplasmas and Hemiptera pathogensTravaux en français237 207