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Enregistrement W2060992919 · doi:10.5858/arpa.2010-0560-oa

Loss of Expression of DNA Mismatch Repair Proteins Is Rare in Pancreatic and Small Intestinal Neuroendocrine Tumors

2011· article· en· W2060992919 sur OpenAlexafffund
Thomas Arnason, Heidi Sapp, Daniel Rayson, Penelope J. Barnes, Magdalena Drewniak, Bassam A Nassar, Weei‐Yuarn Huang

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroendocrine Tumor Research Advances
Établissements canadiensCapital District Health AuthorityQueen Elizabeth II Health Sciences CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesKillam TrustsCleveland Clinic FoundationCleveland Clinic
Mots-clésPMS2MSH6Microsatellite instabilityMSH2MLH1Neuroendocrine tumorsBiologyDNA mismatch repairCancer researchPathologyInternal medicineEndocrinologyDNA repairMedicineGeneticsMicrosatelliteDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CONTEXT: Two recent studies have identified a high rate of microsatellite instability (MSI) in pancreatic neuroendocrine tumors (pNETs). Microsatellite instability is rare in small intestinal neuroendocrine tumors (NETs). It is unclear why there is discordance in the frequency of MSI in the 2 studies of pNETs and why this mechanism is comparatively rare in small intestinal tumors. Loss of expression of DNA mismatch repair (MMR) proteins, which is known to correlate strongly with MSI, is not well studied in pancreatic or small intestinal NETs. OBJECTIVE: To determine if there is loss of expression of MMR protein expression in pancreatic or small intestinal NETs. DESIGN: Sixty-nine patients (31 male, 38 female; mean age, 59.2 years) were identified who had a resection for a primary pancreatic (n = 35) or primary small intestinal (n = 34) NET during an 18-year period. Immunohistochemical stains for MLH1, MSH2, MSH6, and PMS2 were applied to archived tissue from all cases. All pNETs with adequate tissue (n = 32) were also assessed by MSI analysis. RESULTS: There was preserved expression of MLH1, MSH2, MSH6, and PMS2 in all 35 pNETs. Of 32 pNETs tested by polymerase chain reaction, 28 were microsatellite stable and DNA did not amplify in 4. In 34 small intestinal NETs, 2 cases had indeterminate MLH1 and 1 case had indeterminate PMS2 expression. The remainder had intact MMR protein expression. CONCLUSION: Defects in DNA MMR proteins are rare in pancreatic and small intestinal NETs, raising doubt that MSI plays a significant role in the pathogenesis of these tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,845

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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