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Enregistrement W2061076297 · doi:10.1021/bi6025837

A Testis Specific Isoform of Endophilin B1, Endophilin B1t, Interacts Specifically with Protein Phosphatase-1cγ2 in Mouse Testis and Is Abnormally Expressed in PP1cγ Null Mice

2007· article· en· W2061076297 sur OpenAlexaff
Christopher Hrabchak, Hannah Henderson, Susannah Varmuza

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene isoformMutantWild typeBiologyProtein phosphatase 1Cell biologyMolecular biologyChemistryPhosphataseGenePhosphorylationBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Male mice homozygous for a null mutation in the protein phosphatase-1c gamma (PP1c gamma) gene are infertile, displaying a severe impairment in spermatogenesis that is not compensated by the presence of PP1c alpha and PP1c beta in mutant testes. A lack of the PP1c gamma2 splice variant seems the most likely cause of the mutant phenotype, as it is the most heavily expressed PP1c gamma isoform in wild type testes. Yeast two-hybrid screening using PP1c gamma2 has identified several new binding partners, including endophilin B1t, a testis enriched isoform of endophilin B1a which differs from the somatic form by virtue of a carboxy terminal deletion spanning the last 10 amino acids. The testis isoform did not show an interaction with PP1c alpha, or with a truncated PP1c gamma2 mutant lacking the unique carboxy terminus. In contrast, somatic endophilin B1a did not interact with any of the PP1c isoforms. Sedimentation and co-immunoprecipitation experiments using native testis proteins verified binding of endophilin B1t to PP1c gamma2. Immunohistochemistry on wild type testis sections revealed a stage specific expression pattern for endophilin that appeared concentrated at discrete puncta throughout the seminiferous epithelium. Punctate endophilin expression in cells adjacent to the lumen was absent in PP1c gamma null mice. Phosphatase assays indicate that chimeric endophilin B1t is able to inhibit recombinant PP1c gamma2 activity toward phosphorylase a while having little effect on the activity of PP1c alpha. A potential role for endophilin B1t in mammalian spermatogenesis is discussed within the context of the PP1c gamma knockout testis phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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