MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2061076810 · doi:10.1136/jmedgenet-2013-101715

A novel mutation in <i>KIAA0196</i>: identification of a gene involved in Ritscher–Schinzel/3C syndrome in a First Nations cohort

2013· article· en· W2061076810 sur OpenAlexafffundabout
Alison M. Elliott, Louise R. Simard, Gail Coghlan, Albert E. Chudley, Bernard N. Chodirker, Cheryl R. Greenberg, Tanya C. Burch, Valentina Ly, Grant M. Hatch, Teresa Zelinski

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFetal and Pediatric Neurological Disorders
Établissements canadiensUniversity of ManitobaWinnipeg Regional Health Authority
Organismes subventionnairesCanada Research ChairsManitoba Medical Service Foundation
Mots-clésSanger sequencingGeneticsBiologyDisease gene identificationMutationGeneCandidate geneSNP arrayExonCohortGenotypeSingle-nucleotide polymorphismExome sequencingMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Ritscher-Schinzel syndrome (RSS) is a clinically heterogeneous disorder characterised by distinctive craniofacial features in addition to cerebellar and cardiac anomalies. It has been described in different populations and is presumed to follow autosomal recessive inheritance. In an effort to identify the underlying genetic cause of RSS, affected individuals from a First Nations (FN) community in northern Manitoba, Canada, were enrolled in this study. METHODS: Homozygosity mapping by SNP array and Sanger sequencing of the candidate genes in a 1Mb interval on chromosome 8q24.13 were performed on genomic DNA from eight FN RSS patients, eight of their parents and five unaffected individuals (control subjects) from this geographic isolate. RESULTS: All eight patients were homozygous for a novel splice site mutation in KIAA0196. RNA analysis revealed an approximate eightfold reduction in the relative amount of a KIAA0196 transcript lacking exon 27. A 60% reduction in the amount of strumpellin protein was observed on western blot. CONCLUSIONS: We have identified a mutation in KIAA0196 as the cause of the form of RSS characterised in our cohort. The ubiquitous expression and highly conserved nature of strumpellin, the product of KIAA0196, is consistent with the complex and multisystem nature of this disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,365

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Medical GeneticsMême sujetFetal and Pediatric Neurological DisordersTravaux en français237 207