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Enregistrement W2061209982 · doi:10.1371/journal.pone.0053503

Characterization of Growth Suppressive Functions of a Splice Variant of Cyclin D2

2013· article· en· W2061209982 sur OpenAlexaff
Karim Wafa, Jessica MacLean, Feixiong Zhang, Kishore B.S. Pasumarthi

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyBiologyCell cycleRetinoblastoma proteinF-box proteinUbiquitinCyclin-dependent kinase 1ImmunoprecipitationMolecular biologyUbiquitin ligaseCell cultureApoptosisBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have recently cloned a novel splice variant of cyclin D2 termed as cycD2SV. CycD2SV overexpression in several immortalized cell lines led to formation of ubiquitinated protein aggregates accompanied by a significant decrease in cell proliferation. Based on immuno co-localization and ultrastructural analysis experiments, cycD2SV protein aggregates were frequently found in various subcellular compartments such as endosomes, autophagosomes, lysosomes and the microtubule organizing centre. Secondary structure analysis revealed that the amino terminal α-helix in cycD2SV is not tightly packed with the cyclin box suggesting a misfolded conformation compared to other cyclins. Deletion analysis suggests that 1-53 amino acid region of cycD2SV may be required for protein aggregation and 54-136 amino acid region may mediate cell cycle inhibition. Based on co-immunoprecipitation experiments, we have shown that cycD2SV binds to cycD2 as well as CDK4. In addition, gene expression analysis demonstrated an upregulation in GADD45α and dynamin 2 mRNA levels in cycD2SV overexpressing cells. These two proteins are known to play critical roles in the DNA damage response and apoptosis pathways. TUNEL experiments were negative for apoptosis, however, cycD2SV expressing cells were more sensitive to cell death induced by external stressors such as trypsinization. Collectively our results suggest that cycD2SV mediates cell cycle inhibition by sequestering endogenous cell cycle proteins, such as cycD2 and CDK4, and possibly targeting them for ubiquitin mediated protein degradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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