MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2061230511 · doi:10.1073/pnas.0812383106

The crystal structure of the C-terminus of adseverin reveals the actin-binding interface

2009· article· en· W2061230511 sur OpenAlexafffund
Sakesit Chumnarnsilpa, Wei Lin Lee, Shalini Nag, B. Kannan, Mårten Larsson, Leslie D. Burtnick, Robert Robinson

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBiomedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of British ColumbiaNational Science CouncilMichael Smith Health Research BCHeart and Stroke Foundation of British Columbia and YukonHoward Hughes Medical InstituteAgency for Science, Technology and ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésGelsolinActinActin-binding proteinBinding siteActin remodelingBiologyChemistryCell biologyBiophysicsActin cytoskeletonBiochemistryCytoskeletonCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adseverin is a member of the calcium-regulated gelsolin superfamily of actin severing and capping proteins. Adseverin comprises 6 homologous domains (A1-A6), which share 60% identity with the 6 domains from gelsolin (G1-G6). Adseverin is truncated in comparison to gelsolin, lacking the C-terminal extension that masks the F-actin binding site in calcium-free gelsolin. Biochemical assays have indicated differences in the interaction of the C-terminal halves of adseverin and gelsolin with actin. Gelsolin contacts actin through a major site on G4 and a minor site on G6, whereas adseverin uses a site on A5. Here, we present the X-ray structure of the activated C-terminal half of adseverin (A4-A6). This structure is highly similar to that of the activated form of the C-terminal half of gelsolin (G4-G6), both in arrangement of domains and in the 3 bound calcium ions. Comparative analysis of the actin-binding surfaces observed in the G4-G6/actin structure suggests that adseverin in this conformation will also be able to interact with actin through A4 and A6, whereas the A5 surface is obscured. A single residue mutation in A4-A6 located at the predicted A4/actin interface completely abrogates actin sequestration. A model of calcium-free adseverin, constructed from the structure of gelsolin, predicts that in the absence of a gelsolin-like C-terminal extension the interaction between A2 and A6 provides the steric inhibition to prevent interaction with F-actin. We propose that calcium binding to the N terminus of adseverin dominates the activation process to expose the F-actin binding site on A2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,186

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueProceedings of the National Academy of SciencesMême sujetCellular Mechanics and InteractionsTravaux en français237 207