Expression analysis and physical mapping of low-molecular-weight glutenin loci in hexaploid wheat (<i>Triticum aestivum</i>L.)
Notice bibliographique
Résumé
Gliadins and glutenins are storage proteins important in determining the bread-, noodle-, and pasta-making quality of wheat. Glutenins consist of HMW and LMW subunits. The Glu-A3, Glu-B3, and Glu-D3 loci on the short arms of chromosomes 1A, 1B, and 1D, respectively, are the major loci for LMW glutenins. To construct physical maps of the Glu-3 loci, a set of 24 high-density filters representing a 3.1x genome coverage hexaploid wheat BAC library was screened by hybridization using a probe made of 3 LMW glutenin sequences. After 2 rounds of hybridization, a subset of 536 BAC clones were selected and fingerprinted. Three developing seed cDNA libraries were also constructed. A total of 5000-6000 ESTs were generated from each library, assembled into contigs and searched by homology for LMW glutenin sequences. In total, 90 full-length LMW glutenin sequences were found to cluster into 8 distinct groups representing at least 21 different LMW glutenin subunits. A set of 24 pairs of PCR primers was designed from these groups and used as markers on the BAC clones. The combined fingerprinting and marker data were used to build the physical maps using FPC software. A total of 91 contigs comprising 254 clones were obtained and 282 clones remained singletons.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».