Virulence in populations of <i>Puccinia graminis</i> f.sp. <i>tritici</i> in Canada from 1952 to 1998: a non-parametric analysis
Notice bibliographique
Résumé
Six hundred and twenty six isolates of Puccinia graminis f.sp. tritici that were collected and stored between 1952 and 1998 were identified using 32 single-gene differential wheat lines. These pathotypes represented isolates from field surveys, nursery collections, and from greenhouse experiments. Infection type data was converted to a binary data matrix with a 0 (resistant) or 1 (susceptible) numeral assigned to each isolate for each differential line. The Gower coefficient of similarity was determined for every pair of isolates, then they were clustered using the non-parametric cluster analysis MODECLUS. Eight significantly different clusters were obtained from an overall heterogeneous database of 405 unique pathotypes representing all regions of Canada. For further analysis, isolates obtained only from field survey collections were selected and divided by region of collection into Pacific (45 pathotypes), prairie (191 pathotypes), and eastern Canadian (83 pathotypes) populations. The Pacific population, which was both sexually and asexually reproducing, consisted of two clusters. The prairie population, strictly asexually reproducing, consisted of nine clusters, and the eastern population, which may be partially sexually reproducing, had three clusters. The Pacific population was shown to be significantly different from the prairie and eastern populations, while the prairie and eastern populations were less distinct. The pathotype composition of the regional clusters, reliability of cluster segregation using non-parametric analysis, and usefulness of the data to contribute to a revised nomenclature of P. graminis f.sp. tritici, are evaluated.Key words: stem rust, black rust, wheat, specific virulence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».