Expression of RAS-like family members, c-jun and c-myc mRNA levels in neoplastic hemocytes of soft-shell clams Mya arenaria using microsphere-based 8-plex branched DNA assay
Notice bibliographique
Résumé
The molecular mechanisms by which disseminated neoplasia (DN) is developed in soft shell clams Mya arenaria remain largely unknown. This study aims at quantifying Rho-like GTPase, RAS-Rho, RAS-related C3 botulinum (RAS C3), c-jun as well as c-myc transcript levels in clams sampled at North River (Charlottetown, Prince Edward Island, Canada). The transcripts were quantified using multiplex gene analysis (Quantigene(®) 2 Plex, Affymetrix) in 3 groups of clams: (1) Group C (healthy clams considered as control) with a low percentage of tetraploid hemocytes (<10%); (2) Group D (disease in development): individuals presenting a percentage of tetraploid cells ranging between 10% and 50%; (3) Group E (established disease): clams with a high percentage of tetraploid hemocytes (>50%). Data showed a down-regulation of Rho-like GTPase, Rho-like subfamily, RAS C3, c-jun and an up-regulation of c-myc gene expression. It is believed that a deregulation of the expression of these genes could partly unravel the molecular mechanisms involved in the development of DN in soft shell clams Mya arenaria. Further investigations should be pursued to determine the role of these gene products in clams' hemocytes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».