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Enregistrement W2062052463 · doi:10.1096/fj.14-258780

Decreased nuclear receptor activity and epigenetic modulation associates with down‐regulation of hepatic drug‐metabolizing enzymes in chronic kidney disease

2014· article· en· W2062052463 sur OpenAlexaff
Thomas J. Velenosi, David A. Feere, Gurjeev Sohi, Daniel B. Hardy, Bradley L. Urquhart

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPregnane X receptorNuclear receptorChromatin immunoprecipitationAcetylationEpigeneticsHistoneKidney diseaseInternal medicineBiologyEndocrinologyReceptorPromoterMolecular biologyGene expressionMedicineTranscription factorGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Patients with chronic kidney disease (CKD) require many medications. CYP2C and CYP3A drug‐metabolizing enzymes play a critical role in determining the pharmacokinetics of the majority of prescribed medications. These enzymes are transcriptionally regulated by the nuclear receptors pregnane X receptor (PXR) and hepatic nuclear factor 4α (HNF4α). Expression of CYP2C and CYP3A is decreased in CKD; however, the mechanisms by which this occurs is unknown. We induced CKD in rats by 5/6 nephrectomy and used chromatin immunoprecipitation (ChIP) to determine nuclear receptor‐ and epigenetic alteration‐mediated differences in the promoter region of the CYP2C and CYP3A genes. RNA polymerase II and HNF‐4α binding was decreased 76 and 57% in the CYP2C11 promotor and 71 and 77% in the CYP3A2 promoter, respectively ( P <0.05). ChIP also revealed a 57% decrease in PXR binding to the CYP3A2 promoter in CKD rats ( P <0.05). The decrease in PXR and HNF‐4α binding was accompanied by diminished histone 4 acetylation in the CYP3A2 promoter (48%) and histone 3 acetylation in the CYP2C11 (77%) and CYP3A2 (77%) promoter loci for nuclear receptor activation ( P <0.05). This study suggests that decreased nuclear receptor binding and histone acetylation may contribute to the mechanism of drug‐metabolizing enzyme down‐regulation and altered pharmacokinetics in CKD.–Velenosi, T. J., Feere, D. A., Sohi, G., Hardy, D. B., Urquhart, B. L. Decreased nuclear receptor activity and epigenetic modulation associates with down‐regulation of hepatic drug‐metabolizing enzymes in chronic kidney disease. FASEB J. 28, 5388–5397 (2014). www.fasebj.org

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,568
Score d'incertitude au seuil0,572

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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