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Enregistrement W2062080206 · doi:10.1097/ede.0b013e31821b5332

The Coding Causes of Death in HIV (CoDe) Project

2011· article· en· W2062080206 sur OpenAlexaff
Justyna Kowalska, Nina Friis‐Møller, Ole Kirk, Wendy Bannister, Amanda Mocroft, Caroline Sabin, Peter Reiss, M. John Gill, Charlotte Lewden, Andrew Phillips, Antonella d’Arminio Monforte, Matthew Law, Jonathan A C Sterne, Stéphane De Wit, Jens Lundgren

Notice bibliographique

RevueEpidemiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV-related health complications and treatments
Établissements canadiensSouth Health Campus
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCoding (social sciences)Human immunodeficiency virus (HIV)Code (set theory)VirologyMedicineComputer scienceProgramming languageStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The Coding Causes of Death in HIV (CoDe) Project aims to deliver a standardized method for coding the underlying cause of death in HIV-positive persons, suitable for clinical trials and epidemiologic studies. METHODS: The project incorporates detailed data collection, a classification system, and a centralized adjudication process performed by 2 independent reviewers. The methodology was tested in the Data Collection on Adverse events of Anti-HIV Drugs Study , and independent reviews of causes of death were compared. Logistic regression models identified factors associated with initial agreement by reviewers on underlying cause of death. RESULTS: A total of 491 reported fatal cases were adjudicated; in only 5% of cases the cause of death remained undetermined after adjudication. Reviewers initially agreed on the underlying cause for 339 (69%) deaths. As compared with deaths due to AIDS-related causes, the odds of agreement were more than 80% lower when deaths were ultimately deemed to be due to non-AIDS-related causes (odds ratio = 0.17 [95% confidence interval = 0.08-0.37]) or undetermined causes (0.11 [0.04-0.36]). The odds of initial agreement were also lower for deaths occurring in subjects with hypertension (0.43 [0.22-0.85]) and depression (0.43 [0.23-0.80]). CONCLUSIONS: The extent and format of data collected in the CoDe Project appear to be sufficient for an informed review, and the proposed coding scheme is adequate for obtaining an underlying cause of death.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,265
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,511
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,265
Score d'incertitude au seuil0,906

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2650,511
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0140,010
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0040,013
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,236
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations143
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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