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Genome-Wide Analysis of the World's Sheep Breeds Reveals High Levels of Historic Mixture and Strong Recent Selection

2012· article· en· 961 citations· W2062290915 sur OpenAlex· 10.1371/journal.pbio.1001258

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Résumé

Through their domestication and subsequent selection, sheep have been adapted to thrive in a diverse range of environments. To characterise the genetic consequence of both domestication and selection, we genotyped 49,034 SNP in 2,819 animals from a diverse collection of 74 sheep breeds. We find the majority of sheep populations contain high SNP diversity and have retained an effective population size much higher than most cattle or dog breeds, suggesting domestication occurred from a broad genetic base. Extensive haplotype sharing and generally low divergence time between breeds reveal frequent genetic exchange has occurred during the development of modern breeds. A scan of the genome for selection signals revealed 31 regions containing genes for coat pigmentation, skeletal morphology, body size, growth, and reproduction. We demonstrate the strongest selection signal has occurred in response to breeding for the absence of horns. The high density map of genetic variability provides an in-depth view of the genetic history for this important livestock species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
PLoS Biology
Thématique
Genetic and phenotypic traits in livestock
Domaine
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens
Organismes subventionnaires
National Chemical LaboratoryAristotle University of ThessalonikiHáskóli ÍslandsUniversity College DublinUniversity of CyprusUniversity of AlbertaUniversidad de LeónAdnan Menderes ÜniversitesiUniversity of PeradeniyaInstitut National de la Recherche AgronomiqueUniversity of New EnglandCommonwealth Scientific and Industrial Research OrganisationInstitute of GeneticsCyprus University of TechnologyUniversität HohenheimChinese Academy of Agricultural SciencesInternational Atomic Energy AgencyLandbúnaðarháskóli ÍslandsMeat and Livestock AustraliaU.S. Department of Agriculture
Mots-clés
BiologyDomesticationSelection (genetic algorithm)Genetic diversityEvolutionary biologyCoatGenetic variationPopulationLivestockGeneticsHaplotypeGeneGenotypeEcology
Résumé présent dans OpenAlex
oui