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Enregistrement W2062350326 · doi:10.1371/journal.pone.0002408

Disturbance of Social Hierarchy by an Invasive Species: A Gene Transcription Study

2008· article· en· W2062350326 sur OpenAlexafffund
Christian Roberge, Simon Blanchet, Julian J. Dodson, Helga Guderley, Louis Bernatchez

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReproductive biology and impacts on aquatic species
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies
Mots-clésBiologyRainbow troutSalmoDominance hierarchyPhenotypic plasticityEvolutionary biologyGeneGeneticsDominance (genetics)EcologyFisheryAggression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Ecological and evolutionary changes in native populations facing invasion by exotic species are increasingly reported. Recently, it has been shown that competition with exotic rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) disrupts dominance hierarchies within groups of native Atlantic salmon (Salmo salar). The genetic and molecular actors underlying phenotypic plasticity are poorly understood. METHODOLOGY: Here, we aimed at identifying the genetic and molecular actors contributing to this plastic loss of dominance hierarchies as well as at identifying genes implicated in behaviours related to social dominance. By using microarrays, we compared the genome-wide gene transcription profiles in brains of dominant versus subordinate juvenile Atlantic salmon in presence or absence of a competitive rainbow trout. PRINCIPAL FINDINGS: Adding the trout competitor resulted in dominant and subordinate salmon being more similar, both behaviourally and at the level of brain gene transcription patterns. Genes for which transcription levels differed between dominant and subordinate salmon in the absence of exotic trout were mainly over-expressed in dominant salmon and included genes implicated in protein turnover, neuronal structural change and oxygen transport. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: Our study provides one of the few examples demonstrating a close interplay between behavioural plasticity and gene transcription, therefore contributing to the understanding of the molecular mechanisms underlying these processes in an ecologically relevant context.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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