Heterodimerization of BAK and MCL-1 Activated by Detergent Micelles
Notice bibliographique
Résumé
BAK is a key protein mediating mitochondrial outer membrane permeabilization; however, its behavior in the membrane is poorly understood. Here, we characterize the conformational changes in BAK and MCL-1 using detergents to mimic the membrane environment and study their interaction by in vitro pulldown experiments, size exclusion chromatography, titration calorimetry, and NMR spectroscopy. The nonionic detergent IGEPAL has little impact on the structure of MCL-1 but induces a conformational change in BAK, whereby its BH3 region is able to engage the hydrophobic groove of MCL-1. Although the zwitterionic detergent CHAPS induces only minor conformational changes in both proteins, it is still able to initiate heterodimerization. The complex of MCL-1 and BAK can be disrupted by a BID-BH3 peptide, which acts through binding to MCL-1, but a mutant peptide, BAK-BH3-L78A, with low affinity for MCL-1 failed to dissociate the complex. The mutation L78A in BAK prevented binding to MCL-1, thus demonstrating the essential role of the BH3 region of BAK in its regulation by MCL-1. Our results validate the current models for the activation of BAK and highlight the potential value of small molecule inhibitors that target MCL-1 directly.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».