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Enregistrement W2062450530 · doi:10.1097/00007890-200107270-00027

A COMPARISON OF GENE EXPRESSION IN MURINE CARDIAC ALLOGRAFTS AND ISOGRAFTS BY MEANS DNA MICROARRAY ANALYSIS1

2001· article· en· W2062450530 sur OpenAlexaff
Akio Saiura, Chikage Mataki, Takeshi Murakami, Michihisa Umetani, Yoichiro Wada, Takahide Kohro, Hiroyuki Aburatani, Yasushi Harihara, Takao Hamakubo, Takuhiro Yamaguchi, Go Hasegawa, Makoto Naito, Masatoshi Makuuchi, Tatsuhiko Kodama

Notice bibliographique

RevueTransplantation · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensPancreas Centre (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIsograftBiologyGene expressionTransplantationMolecular biologyGeneMicroarrayDNA microarrayMicroarray analysis techniquesInterferon gammaImmunologyImmune systemMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Acute rejection of allografts remains a significant problem in clinical transplantation, and the fundamental mechanism underlying this rejection are as yet only poorly elucidated. Recently, DNA microarrays have come into use for the study of gene expression profiles, and we have taken advantage of this new technology to investigate acute rejection. We compared mRNA profiles in murine cardiac allografts with isografts using DNA microarrays with probe sets corresponding to more than 11,000 mice genes. METHODS: We screened for gene expression changes in murine cardiac allografts between fully incompatible mice strains (BALB/c H2d to C3H/He H2k) using a DNA microarray. The heart was heterotopically transplanted. Allografts (BALB/c to C3H/He) were removed on days 1, 3, and 5. As a control, isografts (C3H/He to C3H/He) harvested on days 1, 3, and 5 and native hearts of both strain mice (C3H/He and BALB/c) were obtained. RESULTS: On day 5, interferon-gamma (IFN-gamma) and many IFN-gamma-inducible genes were profoundly induced in the allograft relative to isograft. Monokine induced by IFN-gamma was most profoundly induced followed by inducibly expressed GTPase and Lmp-2. IFN-gamma was also profoundly induced. The induction was detectable from day 3. In contrast, genes regulated by other cytokines exhibited only modest changes. CONCLUSION: IFN-gamma-inducible genes are specifically up-regulated in murine cardiac allografts, suggesting that signaling mediated by IFN-gamma may play an important role in the late phase of acute rejection in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil0,390

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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