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Enregistrement W2062542146 · doi:10.1021/jp8092012

Structural Analysis of Human Serum Albumin Complexes with Cationic Lipids

2009· article· en· W2062542146 sur OpenAlexaff
David M. Charbonneau, Marc Beauregard, Heidar‐Ali Tajmir‐Riahi

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Interaction Studies and Fluorescence Analysis
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCationic polymerizationHuman serum albuminAlbuminSerum albuminChemistryBiochemistryPolymer chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human serum albumin (HSA) is a major transporter for delivering several endogenous compounds including fatty acids in vivo. Even though HSA is the primary target of fatty acid binding, the effects of cationic lipid on protein stability and conformation have not been investigated. The aim of this study was to examine the interaction of human serum albumin (HSA) with helper lipids--cholesterol (Chol) and dioleoylphosphatidylethanolamine (DOPE)--and with cationic lipids--dioctadecyldimethylammonium bromide (DDAB) and 1,2-dioleoyl-3-trimethylammonium-propane (DOTAP), at physiological conditions, using constant protein concentration and various lipid contents. Fourier transform infrared (FTIR), circular dichroism (CD), and fluorescence spectroscopic methods were used to analyze the lipid binding mode, the binding constant, and the effects of lipid interaction on HSA stability and conformation. Structural analysis showed that cholesterol and DOPE (helper lipids) interact mainly with HSA polypeptide polar groups and via hydrophobic moieties. Hydrophobic interactions dominate the binding of cationic lipids to HSA. The number of bound lipids (n) calculated was 1.22 (cholesterol), 1.82 (DDAB), 1.76 (DOPE), and 1.56 (DOTAP). The overall binding constants estimated were KChol=2.3 (+/-0.50)x10(3) M(-1), KDDAB=8.9 (+/-0.95)x10(3) M(-1), KDOTAP=9.1 (+/-0.90)x10(3) M(-1), and KDOPE=4.7 (+/-0.70)x10(3) M(-1). HSA conformation was stabilized by cholesterol and DOPE with a slight increase of protein alpha-helical structures, while DOTAP and DDAB induced an important (alpha-->beta) transition, suggesting a partial protein unfolding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations180
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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