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Enregistrement W2062573656 · doi:10.1101/gad.232082.113

A modular and flexible ESC-based mouse model of pancreatic cancer

2014· article· en· W2062573656 sur OpenAlexaff
Michael Saborowski, Anna Saborowski, John P. Morris, Benedikt Bosbach, Lukas E. Dow, Jerry Pelletier, David S. Klimstra, Scott W. Lowe

Notice bibliographique

RevueGenes & Development · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteLustgarten FoundationDeutsche ForschungsgemeinschaftHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyPancreatic cancerCancer researchKRASTransgeneCancerPTENComputational biologyBioinformaticsGeneticsGeneSignal transductionColorectal cancerPI3K/AKT/mTOR pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetically engineered mouse models (GEMMs) have greatly expanded our knowledge of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) and serve as a critical tool to identify and evaluate new treatment strategies. However, the cost and time required to generate conventional pancreatic cancer GEMMs limits their use for investigating novel genetic interactions in tumor development and maintenance. To address this problem, we developed flexible embryonic stem cell (ESC)-based GEMMs that facilitate the rapid generation of genetically defined multiallelic chimeric mice without further strain intercrossing. The ESCs harbor a latent Kras mutant (a nearly ubiquitous feature of pancreatic cancer), a homing cassette, and other genetic elements needed for rapid insertion and conditional expression of tetracycline-controlled transgenes, including fluorescence-coupled shRNAs capable of efficiently silencing gene function by RNAi. This system produces a disease that recapitulates the progression of pancreatic cancer in human patients and enables the study and visualization of the impact of gene perturbation at any stage of pancreas cancer progression. We describe the use of this approach to dissect temporal roles for the tumor suppressor Pten and the oncogene c-Myc in pancreatic cancer development and maintenance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,540
Score d'incertitude au seuil0,405

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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