Distinct Regions within the Erlins Are Required for Oligomerization and Association with High Molecular Weight Complexes
Notice bibliographique
Résumé
The group of stomatin/prohibitin/flotillin/HflK/C (SPFH) domain-containing proteins comprise members of diverse subcellular localization and function. Association with detergent-resistant membranes (DRMs) and the propensity to form oligomers are two common properties of SPFH domain proteins and likely important for the function of these proteins. Our laboratory recently discovered two novel members of this protein group, which, based on their endoplasmic reticulum (ER) localization and association with DRMs, were named ER lipid raft-associated protein (erlin)-1 and -2. Here we characterized erlin oligomerization and identified domains within the erlins responsible for oligomerization and DRM association. Using co-immunoprecipitation and sucrose density gradient centrifugation approaches on endogenous and ectopically expressed erlin proteins, we found that they formed homo- and hetero-oligomers and were part of large multimeric complexes. These properties were independent of their DRM association. By analyzing truncation and point mutants of erlin-2 we discovered that interaction between erlin monomers (oligomerization) and association with high molecular weight complexes require distinct regions within the protein. Although oligomerization and DRM association were mediated by a region immediately downstream of the SPFH domain (residues 228-300), integration into high molecular weight complexes was absolutely dependent on a phenylalanine residue C-terminal of this region (Phe-305), which lies within a short stretch of hydrophobic residues. Our data demonstrate that lower order oligomerization and incorporation into multimeric complexes are two separate biochemical properties of the erlins, because they are mediated by distinct regions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».