New Populations of <i>Sclerotinia sclerotiorum</i> from Lettuce in California and Peas and Lentils in Washington
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Four populations of Sclerotinia sclerotiorum in North America were inferred previously, based on analyses of both rapidly evolving markers (DNA fingerprint and mycelial compatiblity), and multilocus DNA sequence spanning the range between fast and slow evolution. Each population was defined as an interbreeding unit of conspecific individuals sharing a common recent ancestor and arising in a unique evolutionary event. The present study applies this standard to extend characterization of S. sclerotiorum populations to the Western United States. Isolates of S. sclerotiorum (N = 294) were determined to represent three genetically differentiated populations: California (CA, lettuce), Washington (WA, pea/lentil), and Ontario (ON, lettuce). CA was the most diverse population yet sampled in North America. Clonality was detected in ON and WA. No DNA fingerprints were common among the populations. The index of association (I(A)), based on fingerprint, was closer to zero (0) for CA than it was for the other populations. High diversity and lack of association of markers in California are consistent either with genetic exchange and recombination, or with large population size and high standing genetic variation. Intra- and interlocus conflict among three DNA sequence loci was consistent with recombination. The coalescent IGS genealogy confirmed subdivision and showed CA to be older than WA or ON. The Nearest Neighbor statistic on combined data confirmed subdivision among all present and previously defined populations. All isolates had both MAT1-1 and MAT1-2, consistent with uniform homothallism.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».