Shewanella canadensis sp. nov. and Shewanella atlantica sp. nov., manganese dioxide- and hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine-reducing, psychrophilic marine bacteria
Notice bibliographique
Résumé
Two strains belonging to the genus Shewanella, HAW-EB2(T) and HAW-EB5(T), were isolated previously from marine sediment sampled from the Atlantic Ocean, near Halifax harbour in Canada, for their potential to degrade explosive hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine (RDX). In the present study, strains HAW-EB2(T) and HAW-EB5(T) were found to display high 16S rRNA gene sequence similarity (90-99.5 %) to species of Shewanella, but their gyrB sequences were significantly different from each other and from species of Shewanella (79-87.6 %). Furthermore, DNA-DNA hybridization showed that the genomic DNA of the two strains was only 22 % related and showed less than 41 % relatedness to closely related species of Shewanella. In comparison to other species of Shewanella, strains HAW-EB2(T) and HAW-EB5(T) were also unique in some phenotypic properties such as activities of beta-galactosidase and tyrosine arylamidase and the ability to metabolize certain organic acids and sugars. Both strains HAW-EB2(T) and HAW-EB5(T) utilize malate, valerate, peptone and yeast extract as sole carbon and energy sources. The major membrane fatty acids of the two strains were C(14 : 0), iso-C(15 : 0), C(16 : 0), C(16 : 1)omega7, C(18 : 1)omega7 and C(20 : 5)omega3 and their major quinones were Q-7, Q-8 and MK-7. On the basis of these results, strain HAW-EB2(T) (=NCIMB 14238(T) =CCUG 54553(T)) is proposed as the type strain of Shewanella canadensis sp. nov. and strain HAW-EB5(T) (=NCIMB 14239(T) =CCUG 54554(T)) is proposed as the type strain of Shewanella atlantica sp. nov.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».