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Enregistrement W2063059443 · doi:10.1002/lt.22312

Hepatitis B virus quasispecies in hepatic and extrahepatic viral reservoirs in liver transplant recipients on prophylactic therapy

2011· article· en· W2063059443 sur OpenAlexaff
Carla S. Coffin, Patricia M. Mulrooney‐Cousins, Guido van Marle, John P. Roberts, Tomasz I. Michalak, Norah A. Terrault

Notice bibliographique

RevueLiver Transplantation · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-cléscccDNAViral quasispeciesHepatitis B virusVirologyMedicineLiver transplantationLamivudinePeripheral blood mononuclear cellHepatitis BPolymerase chain reactionVirusBiologyHepatitis C virusTransplantationInternal medicineHBsAgGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The characterization of hepatitis B virus (HBV) quasispecies in different compartments in liver transplant (LT) recipients may be helpful in optimizing prophylaxis regimens. The aims of this study were to evaluate liver, peripheral blood mononuclear cells (PBMC), and plasma samples for HBV and to compare the quasispecies in hepatic and extrahepatic sites in LT recipients on long-term prophylaxis. For 12 patients followed for up to 15 years post-LT, liver, plasma, and PBMC samples [all HBV DNA-negative according to conventional polymerase chain reaction (PCR) assays] were evaluated for HBV DNA by a sensitive nested PCR method [covalently closed circular DNA (cccDNA) for liver and PBMC samples] and by the sequencing and phylogenetic analysis of polymerase quasispecies. For the 10 patients on prophylaxis with no clinical recurrence (median time post-LT = 15.5 months, range = 12-96 months), liver samples were HBV DNA-reactive in 9 of 10 cases, plasma samples were HBV DNA-reactive in 3 of 10 cases, and PBMC samples were HBV DNA-reactive in 2 of 7 cases (including 1 case with HBV cccDNA in PBMCs). The sequence analysis showed that all HBV clones had a wild-type (WT) sequence in the liver and PBMCs. In 2 patients with early HBV recurrence post-LT who were treated with nucleosides only, HBV DNA was detected in serum, PBMC, and liver samples, and HBV cccDNA was found in liver samples. An HBV lamivudine-resistant variant with an M204I mutation was identified in liver (70% and 18% of the clones) and plasma samples (100% of the clones), but a WT sequence was found in 70% and 100% of the PBMC clones. In conclusion, despite prophylaxis and the absence of HBV DNA in serum according to conventional assays, HBV is detectable in the serum, liver, and PBMCs of almost all patients, and this supports the use of continued anti-HBV therapy in this group. Antiviral drug-resistant variants are more frequent in the liver versus PBMCs, but both compartments are potential sources of reinfection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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