Resolving the functions of peptidylprolyl isomerases: insights from the mutagenesis of the nuclear FKBP25 enzyme
Notice bibliographique
Résumé
Peptidylprolyl isomerases have been implicated in chromatin regulation through their association with histones, chromatin-modifying enzymes and DNA-binding transcription factors. As with other post-translational modifications to proteins, a mechanistic understanding of the regulation of biological processes is fostered by loss-of-function studies both in vitro and in vivo. For peptidylprolyl isomerases, this can be accomplished with small-molecule inhibitors with high affinity for the isomerase active site or by mutation of amino acid residues that contribute to catalysis. In the present article, we review caveats to each of these approaches, and place emphasis on the thorough characterization of loss-of-function mutations in FKBPs (FK506-binding proteins). Using a case study of mutagenesis of the nuclear FKBP25 peptidylprolyl isomerase enzyme, we demonstrate that certain mutations generate a loss-of-function phenotype because they induce a complete loss of the FKBP domain fold, whereas other mutations are 'surgical' in that they ablate catalytic isomerase activity, while maintaining domain structure. Peptidylprolyl isomerases are thought to have both catalytic and non-catalytic functions, but differentiating between these mechanisms has proved to be challenging. The domain-destabilizing and surgical mutants described will facilitate the characterization of these two reported functions of peptidylprolyl isomerases.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
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