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Enregistrement W2063105040 · doi:10.1021/bi8022834

Inequivalent Contribution of the Five Tryptophan Residues in the C-Lobe of Human Serum Transferrin to the Fluorescence Increase when Iron is Released

2009· article· en· W2063105040 sur OpenAlexaff
Nicholas G. James, Shaina L. Byrne, Valerie C. Smith, Ross T. A. MacGillivray, Anne B. Mason

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésChemistryTransferrinTryptophanTransferrin receptorFluorescenceMutantBiophysicsReaction rate constantBiochemistryConjugateKineticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human serum transferrin (hTF), with two Fe3+ binding lobes, transports iron into cells. Diferric hTF preferentially binds to a specific receptor (TFR) on the surface of cells, and the complex undergoes clathrin dependent receptor-mediated endocytosis. The clathrin-coated vesicle fuses with an endosome where the pH is lowered, facilitating iron release from hTF. On a biologically relevant time scale (2-3 min), the factors critical to iron release include pH, anions, a chelator, and the interaction of hTF with the TFR. Previous work, in which the increase in the intrinsic fluorescence signal was used to monitor iron release from the hTF/TFR complex, established that the TFR significantly enhances the rate of iron release from the C-lobe of hTF. In the current study, the role of the five C-lobe Trp residues in reporting the fluorescence change has been evaluated (+/-sTFR). Only four of the five recombinant Trp --> Phe mutants produced well. A single slow rate constant for iron release is found for the monoferric C-lobe (FeC hTF) and the four Trp mutants in the FeC hTF background. The three Trp residues equivalent to those in the N-lobe differed from the N-lobe and each other in their contributions to the fluorescent signal. Two rate constants are observed for the FeC hTF control and the four Trp mutants in complex with the TFR: k(obsC1) reports conformational changes in the C-lobe initiated by the TFR, and k(obsC2) is ascribed to iron release. Excitation at 295 nm (Trp only) and at 280 nm (Trp and Tyr) reveals interesting and significant differences in the rate constants for the complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil0,335

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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