Identification of the Ankyrin Repeat Proteins ANKRA and RFXANK as Novel Partners of Class IIa Histone Deacetylases
Notice bibliographique
Résumé
Eighteen human histone deacetylases (HDACs) have been identified, and according to their sequence similarity to yeast homologs, these enzymes are grouped into distinct classes. Within class II, HDAC4, HDAC5, HDAC7, and HDAC9 share similar domain organization both within the N-terminal extension and the C-terminal catalytic domain, thus forming a subclass known as class IIa. These HDACs function as signal-responsive transcriptional corepressors. To gain further insight into their function and regulation, we utilized an N-terminal fragment of HDAC4 as bait in yeast two-hybrid screens, which uncovered myocyte enhancer factor 2C, 14-3-3zeta, and ankyrin repeat family A protein (ANKRA). ANKRA is a poorly characterized protein with an ankyrin repeat domain similar to RFXANK, a subunit of the trimeric transcription factor RFX. Mutations on genes of the RFX subunits and the coactivator CIITA are responsible for the bare lymphocyte syndrome, an immunodeficiency disorder attributed to the lack of major histocompatibility complex class II (MHCII) antigens. Through its ankyrin repeat domain, RFXANK interacted with HDAC4. Two RFXANK-binding sites were found on HDAC4 with one located within residues 118-279 and another within residues 448-666. Interestingly, this deacetylase also interacted with CIITA. Consistent with the physical interaction with RFXANK and CIITA, HDAC4 and homologs repressed MHCII expression. These results identify ANKRA, RFXANK, and CIITA as novel targets of class IIa HDACs and suggest that these deacetylases play a role in regulating MHCII expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».