Epigenetic regulation of <i>Nanog</i> gene in embryonic stem and trophoblast stem cells
Notice bibliographique
Résumé
The Nanog and Oct-4 genes are essential for maintaining pluripotency of embryonic stem (ES) cells and early embryos. We previously reported that DNA methylation and chromatin remodeling underlie the cell type-specific mechanism of Oct-4 gene expression. In the present study, we found that there is a tissue-dependent and differentially methylated region (T-DMR) in the Nanog up-stream region. The T-DMR is hypomethylated in ES cells, but is heavily methylated in trophoblast stem (TS) cells and NIH/3T3 cells, in which the Nanog gene is repressed. Furthermore, in vitro methylation of T-DMR suppressed Nanog promoter activity in reporter assay. Chromatin immunoprecipitation assay revealed that histone H3 and H4 are highly acetylated, and H3 lysine (K) 4 is hypermethylated at the Nanog locus in ES cells. Conversely, histone deacetylation and H3-K4 demethylation occurred in TS cells. Importantly, in TS cells, hypermethylation of H3-K9 and -K27 is found only at the Nanog locus, not the Oct-4 locus, indicating that the combination of histone modifications associated with the Nanog gene is distinct from that of the Oct-4 gene. In conclusion, the Nanog gene is regulated by epigenetic mechanisms involving DNA methylation and histone modifications.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».