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Enregistrement W2063432099 · doi:10.4161/15592294.2014.988041

Comparison of genome-wide and gene-specific DNA methylation between ART and naturally conceived pregnancies

2015· article· en· W2063432099 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueEpigenetics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePrenatal Screening and Diagnostics
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA methylationCpG siteBiologyMethylationEpigeneticsGeneticsGenomeHuman genomeEpigenomicsGeneEpigenetics of physical exerciseMolecular biologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Data linking assisted reproductive technologies (ART) with aberrant DNA methylation is limited and inconclusive. In addition, most studies to date have analyzed only a small number of CpG sites and focused on methylation changes in placentas, while data on cord blood are scarce. Our aim was to compare DNA methylation in cord blood samples from ART (N = 10) and control pregnancies (N = 8) using a genome-wide approach with the Illumina® Infinium Human Methylation27 array, which interrogates 27,578 CpG sites. A total of 733 (2.7%) of the CpG sites were significantly differentially methylated between the 2 groups (P < 0.05), with an overall relative hypomethylation in the ART group (P < 0.001). Differences in DNA methylation were more pronounced for CpG sites in certain types of genomic locations and were related to baseline methylation levels and distance from CpG islands and transcription start sites. ART was associated with significantly higher variation in DNA methylation, suggesting that differences in DNA methylation between cases and controls may result from stochastic (or random) genome-wide changes in DNA methylation in ART pregnancies. We identified 24 candidate genes with 2 or more CpG sites that were significantly different between the IVF and control groups. The current study provides support for the hypothesis that ART or associated subfertility may be associated with genome-wide changes in DNA methylation, and these changes appear to be, at least in part, due to epigenetic instability in ART pregnancies. Further studies are required in order to determine the extent to which such ART-related epigenetic instability may have phenotypic consequences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,407

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle