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Enregistrement W2063505762 · doi:10.1186/1471-2350-12-56

A novel deletion mutation in the TUSC3 gene in a consanguineous Pakistani family with autosomal recessive nonsyndromic intellectual disability

2011· article· en· W2063505762 sur OpenAlex
Muzammil Ahmad Khan, Muhammad Rafiq, Abdul Noor, Nadir Ali, Ghazanfar Ali, John B. Vincent, Muhammad Ansar

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Alliance for Research on Schizophrenia and Depression
Mots-clésGeneticsBiologyLocus (genetics)GeneDisease gene identificationHuman geneticsGenetic linkageConsanguinityMutationExome sequencing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Intellectual disability (ID) is a serious disorder of the central nervous system with a prevalence of 1-3% in a general population. In the past decades, the research focus has been predominantly on X-linked ID (68 loci and 19 genes for non syndromic X linked ID) while for autosomal recessive nonsyndromic ID (NSID) only 30 loci and 6 genes have been reported to date. METHODS: Genome-wide homozygosity mapping with 500 K Nsp1 array (Affymetrix), CNV analysis, PCR based breakpoint mapping and DNA sequencing was performed to explore the genetic basis of autosomal recessive nonsyndromic ID in a large Pakistani family. RESULTS: Data analysis showed linkage at 8p23 locus with common homozygous region between SNPs rs6989820 and rs2237834, spanning a region of 12.494 Mb. The subsequent CNV analysis of the data revealed a homozygous deletion of 170.673 Kb which encompassed the TUSC3 gene. CONCLUSION: We report a novel deletion mutation in TUSC3 gene which is the second gene after TRAPPC9 in which mutation has been identified in more than one family with autosomal recessive NSID. The study will aid in exploring the molecular pathway of cognition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,712
Score d'incertitude au seuil0,602

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle