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Enregistrement W2063651453 · doi:10.1073/pnas.0905841106

Extreme diversity in noncalcifying haptophytes explains a major pigment paradox in open oceans

2009· article· en· W2063651453 sur OpenAlexaff
Ian Probert, Julia Uitz, Hervé Claustre, Stéphane Aris‐Brosou, Miguel J. Frada, Fabrice Not, Colomban de Vargas

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésHaptophyteBiologyBiodiversityEcologyEvolutionary biologyPhotic zonePhytoplankton

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The current paradigm holds that cyanobacteria, which evolved oxygenic photosynthesis more than 2 billion years ago, are still the major light harvesters driving primary productivity in open oceans. Here we show that tiny unicellular eukaryotes belonging to the photosynthetic lineage of the Haptophyta are dramatically diverse and ecologically dominant in the planktonic photic realm. The use of Haptophyta-specific primers and PCR conditions adapted for GC-rich genomes circumvented biases inherent in classical genetic approaches to exploring environmental eukaryotic biodiversity and led to the discovery of hundreds of unique haptophyte taxa in 5 clone libraries from subpolar and subtropical oceanic waters. Phylogenetic analyses suggest that this diversity emerged in Paleozoic oceans, thrived and diversified in the permanently oxygenated Mesozoic Panthalassa, and currently comprises thousands of ribotypic species, belonging primarily to low-abundance and ancient lineages of the "rare biosphere." This extreme biodiversity coincides with the pervasive presence in the photic zone of the world ocean of 19'-hexanoyloxyfucoxanthin (19-Hex), an accessory photosynthetic pigment found exclusively in chloroplasts of haptophyte origin. Our new estimates of depth-integrated relative abundance of 19-Hex indicate that haptophytes dominate the chlorophyll a-normalized phytoplankton standing stock in modern oceans. Their ecologic and evolutionary success, arguably based on mixotrophy, may have significantly impacted the oceanic carbon pump. These results add to the growing evidence that the evolution of complex microbial eukaryotic cells is a critical force in the functioning of the biosphere.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,431
Score d'incertitude au seuil0,292

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations296
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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