Phosphorylation of the 12 S globulin cruciferin in wild-type and <i>abi1</i>-<i>1</i> mutant <i>Arabidopsis thaliana</i> (thale cress) seeds
Notice bibliographique
Résumé
Cruciferin (a 12 S globulin) is the most abundant storage protein in the seeds of Arabidopsis thaliana (thale cress) and other crucifers, sharing structural similarity with the cupin superfamily of proteins. Cruciferin is synthesized as a precursor in the rough endoplasmic reticulum. Subunit assembly is accompanied by structural rearrangements involving proteolysis and disulfide-bond formation prior to deposition in protein storage vacuoles. The A. thaliana cv. Columbia genome contains four cruciferin loci, two of which, on the basis of cDNA analysis, give rise to three alternatively spliced variants. Using MS, we confirmed the presence of four variants encoded by genes At4g28520.1, At5g44120.3, At1g03880.1 and At1g3890.1 in A. thaliana seeds. Two-dimensional gel electrophoresis, along with immunological detection using anti-cruciferin antiserum and antibodies against phosphorylated amino acid residues, revealed that cruciferin was the major phosphorylated protein in Arabidopsis seeds and that polymorphism far exceeded that predicted on the basis of known isoforms. The latter may be attributed, at least in part, to phosphorylation site heterogeneity. A total of 20 phosphorylation sites, comprising nine serine, eight threonine and three tyrosine residues, were identified by MS. Most of these are located on the IE (interchain disulfide-containing) face of the globulin trimer, which is involved in hexamer formation. The implications of these findings for cruciferin processing, assembly and mobilization are discussed. In addition, the protein phosphatase 2C-impaired mutant, abi1-1, was found to exhibit increased levels of cruciferin phosphorylation, suggesting either that cruciferin may be an in vivo target for this enzyme or that abi1-1 regulates the protein kinase/phosphatase system required for cruciferin phosphorylation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».