The S2 subsites of cathepsins K and L and their contribution to collagen degradation
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The exchange of residues 67 and 205 of the S2 pocket of human cysteine cathepsins K and L induces a permutation of their substrate specificity toward fluorogenic peptide substrates. While the cathepsin L-like cathepsin K (Tyr67Leu/Leu205Ala) mutant has a marked preference for Phe, the Leu67Tyr/Ala205Leu cathepsin L variant shows an effective cathepsin K-like preference for Leu and Pro. A similar turnaround of inhibition was observed by using specific inhibitors of cathepsin K [1-(N-Benzyloxycarbonyl-leucyl)-5-(N-Boc-phenylalanyl-leucyl)carbohydrazide] and cathepsin L [N-(4-biphenylacetyl)-S-methylcysteine-(D)-Arg-Phe-beta-phenethylamide]. Molecular modeling studies indicated that mutations alter the character of both S2 and S3 subsites, while docking calculations were consistent with kinetics data. The cathepsin K-like cathepsin L was unable to mimic the collagen-degrading activity of cathepsin K against collagens I and II, DQ-collagens I and IV, and elastin-Congo Red. In summary, double mutations of the S2 pocket of cathepsins K (Y67L/L205A) and L (L67Y/A205L) induce a switch of their enzymatic specificity toward small selective inhibitors and peptidyl substrates, confirming the key role of residues 67 and 205. However, mutations in the S2 subsite pocket of cathepsin L alone without engineering of binding sites to chondroitin sulfate are not sufficient to generate a cathepsin K-like collagenase, emphasizing the pivotal role of the complex formation between glycosaminoglycans and cathepsin K for its unique collagenolytic activity.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle