MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2063764068 · doi:10.1074/jbc.m111.276790

Interleukin-1β Induces Increased Transcriptional Activation of the Transforming Growth Factor-β-activating Integrin Subunit β8 through Altering Chromatin Architecture

2011· article· en· W2063764068 sur OpenAlexfundno aff
Jennifer A. Markovics, Jun Araya, Stephanie Cambier, Sangeeta Somanath, Stephanie E. Gline, David M. Jablons, Arthur C. Hill, Paul J. Wolters, Stephen L. Nishimura

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Heart, Lung, and Blood InstituteU.S. Public Health ServiceNational Institutes of HealthYork UniversityMoffitt Cancer Center
Mots-clésIntegrinCell biologyCytokineChromatinTransforming growth factorBiologyTranscription factorChemistryIntegrin, beta 6Molecular biologyCancer researchReceptorImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The integrin αvβ8 is a cell surface receptor for the latent domain (LAP) of the multifunctional cytokine TGF-β. Through its association with LAP, TGF-β is maintained in a latent form that must be activated to function. Binding to the integrin αvβ8 with subsequent metalloproteolytic cleavage of LAP represents a major mechanism of TGF-β activation in vivo. Altered expression of the integrin β8 subunit (ITGB8) is found in human chronic obstructive pulmonary disease, cancers, and brain vascular malformations. We have previously shown that the proinflammatory cytokine interleukin-1β (IL-1β) increases ITGB8 expression on lung fibroblasts, which increases αvβ8-mediated TGF-β activation in fibrosis and pathologic inflammation. Here we report the mechanism of increased ITGB8 expression by IL-1β. Our data support a model where the chromatin architecture of the ITGB8 core promoter is altered by nucleosomal repositioning that enhances the interaction of an AP1 complex (containing c-Jun and ATF2). This repositioning is caused by the dissociation of HDAC2 with the ITGB8 core promoter, leading to increased histone H4 acetylation and a loosening of nucleosomal-DNA interactions allowing "opening" of the chromatin structure and increased association of c-Jun and ATF-2. These changes are mediated through NFκB- and p38-dependent pathways. Ultimately, these events culminate in increasing ITGB8 transcription, αvβ8 surface expression, and αvβ8-mediated TGFβ activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,790

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetCell Adhesion Molecules ResearchTravaux en français237 207