Atomic force microscopy study of the role of LPS O‐antigen on adhesion of<i>E. coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
The O-antigen is a highly variable component of the lipopolysaccharide (LPS) among Escherichia coli strains and is useful for strain identification and assessing virulence. While the O-antigen has been chemically well characterized in terms of sugar composition, physical properties such as O-antigen length of E. coli LPS have not been well studied, even though LPS length is important for determining binding of bacteria to biomolecules and epithelial cells. Atomic force microscopy (AFM) was used to characterize the physicochemical properties of the LPS of eight E. coli strains. Steric repulsion between the AFM tip (silicon nitride) and the E. coli cells was measured and modeled, to determine LPS lengths for three O157 and two O113 E. coli strains, and three control (K12) strains that do not express the O-antigen. For strains with an O-antigen, the LPS lengths ranged from 17 +/- 10 to 37 +/- 9 nm, and LPS length was positively correlated with the force of adhesion (F(adh)). Longer lengths of LPS may have allowed for more hydrogen bonding between the O-antigen and silanol groups of the AFM silicon nitride tip, which controlled the magnitude of F(adh). For control strains, LPS lengths ranged from 3 +/- 2 to 5 +/- 3 nm, and there was no relationship between LPS length and adhesion force between the bacterium and the silicon nitride tip. In the absence of the O-antigen, we attributed F(adh) to electrostatic interactions with lipids in the bacterial membrane.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».