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Enregistrement W2063893413 · doi:10.1371/journal.pone.0027486

A Unique Role of GATA1s in Down Syndrome Acute Megakaryocytic Leukemia Biology and Therapy

2011· article· en· W2063893413 sur OpenAlexaff
Ana C. Xavier, Holly Edwards, Alan A. Dombkowski, Tuğçe B. Balcı, Jason N. Berman, Graham Dellaire, Chengzhi Xie, Steven Buck, Larry H. Matherly, Yubin Ge, Jeffrey W. Taub

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensDalhousie UniversityIzaak Walton Killam Health Centre
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute of Environmental Health SciencesBarbara Ann Karmanos Cancer InstituteWayne State UniversityLeukemia and Lymphoma Society
Mots-clésDaunorubicinGene knockdownSmall hairpin RNAGATA1BiologyNPM1Chromatin immunoprecipitationCancer researchMolecular biologyCell cycleApoptosisLeukemiaCell biologyGene expressionImmunologyGeneHaematopoiesisPromoterGeneticsStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Acute megakaryocytic leukemia (AMkL) in Down syndrome (DS) children is uniformly associated with somatic GATA1 mutations, which result in the synthesis of a shorter protein (GATA1s) with altered transactivation activity compared to the wild-type GATA1. It is not fully established whether leukemogenesis and therapeutic responses in DS AMkL patients are due to loss of the wild-type GATA1 or due to a unique function of GATA1s. METHODOLOGY: Stable clones of CMK cells with decreased GATA1s or Bcl-2 levels were generated by using GATA1- or BCL-2-specific lentivirus shRNAs. In vitro ara-C, daunorubicin, and VP-16 cytotoxicities of the shRNA stable clones were determined by using the Cell Titer-blue reagent. Apoptosis and cell cycle distribution were determined by flow cytometry analysis. Changes in gene transcript levels were determined by gene expression microarray and/or real-time RT-PCR. Changes in protein levels were measured by Western blotting. In vivo binding of GATA1s to IL1A promoter was determined by chromatin immunoprecipitation assays. RESULTS: Lentivirus shRNA knockdown of the GATA1 gene in the DS AMkL cell line, CMK (harbors a mutated GATA1 gene and only expresses GATA1s), resulting in lower GATA1s protein levels, promoted cell differentiation towards the megakaryocytic lineage and repressed cell proliferation. Increased basal apoptosis and sensitivities to ara-C, daunorubicin, and VP-16 accompanied by down-regulated Bcl-2 were also detected in the CMK GATA1 shRNA knockdown clones. Essentially the same results were obtained when Bcl-2 was knocked down with lentivirus shRNA in CMK cells. Besides Bcl-2, down-regulation of GATA1s also resulted in altered expression of genes (e.g., IL1A, PF4, and TUBB1) related to cell death, proliferation, and differentiation. CONCLUSION: Our results suggest that GATA1s may facilitate leukemogenesis and potentially impact therapeutic responses in DS AMkL by promoting proliferation and survival, and by repressing megakaryocytic lineage differentiation, potentially by regulating expression of Bcl-2 protein and other relevant genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,486

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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