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Enregistrement W2063942008 · doi:10.1359/jbmr.2002.17.10.1752

Mapping Quantitative Trait Loci That Influence Femoral Cross-sectional Area in Mice

2002· article· en· W2063942008 sur OpenAlexfundno aff
Robert F. Klein, Renn J. Turner, Lisa D. Skinner, Kristina Vartanian, Maqsood Serang, Amy Carlos, Marie Shea, John K. Belknap, Eric Orwoll

Notice bibliographique

RevueJournal of Bone and Mineral Research · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNational Institutes of HealthFondation Pour La Conservation Du Saumon Atlantique
Mots-clésQuantitative trait locusInbred strainBiologyPopulationLocus (genetics)Bone mineralGeneticsEndocrinologyInternal medicineGeneOsteoporosisMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Size and shape are critical determinants of the mechanical properties of skeletal elements and can be anticipated to be highly heritable. Moreover, the genes responsible may be independent of those that regulate bone mineral density (BMD). To begin to identify the heritable determinants of skeletal geometry, we have examined femoral cross-sectional area (FCSA) in male and female mice from two inbred strains of mice with divergent FCSA (C57BL/6 [B6] and DBA/2 [D2]), a large genetically heterogeneous population (n = 964) of B6D2F2 mice and 18 BXD recombinant inbred (RI) strains derived from their F2 cross. Femora were harvested from 16-week-old mice and FCSA (bone and marrow space enclosed within the periosteum) was measured at the midshaft by digital image analysis. In all mouse populations examined, FCSA was positively correlated with body weight and weight-corrected FCSA (WC-FCSA) values were normally distributed in the BXD-RI and F2 populations, suggesting polygenic control of this trait. Genome-wide quantitative trait locus (QTL) analysis of the B6D2F2 population revealed regions on four different chromosomes that were very strongly linked to WC-FCSA (chromosomes 6, 8, 10, and X) in both genders. Evidence of gender-specific genetic influences on femoral geometry was also identified at three other chromosomal sites (chromosomes 2, 7, and 12). Supporting evidence for the WC-FCSA QTLs on chromosomes 2, 7, 8, 10, and 12 also was present in the RI strains. Interestingly, none of these WC-FCSA QTLs were identified in our previous QTL analysis of whole body BMD in the same B6D2F2 population. Thus, the genetic determinants of bone size appear to be largely, if not entirely, distinct from those that regulate BMD attainment. The identification of the genes responsible for geometric differences in bone development should reveal fundamentally important processes in the control of skeletal integrity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,268
Score d'incertitude au seuil0,353

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,194
Tête enseignante GPT0,420
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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