Genome wide Gene Expression Analysis of the Posterior Capsule in Patients with Osteoarthritis and Knee Flexion Contracture
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Knee flexion contractures (KFC) are limitations in the ability to fully extend the knee joint. In people with knee osteoarthritis (OA), KFC are common, impair function, and worsen outcomes after arthroplasty. In KFC, the posterior knee capsule is believed to play a key role, but the pathophysiology remains poorly understood. We sought to identify gene expression differences in the posterior knee capsule of patients with OA with and without KFC. METHODS: Capsule tissue was obtained from the knees of 12 subjects diagnosed with advanced-stage OA at the time of knee arthroplasty surgery. The presence or absence of KFC allocated patients into 2 groups using a case-control design. Genomewide capsular gene expression was compared between the 2 patient groups. Confirmation of differential expression of the corresponding proteins was performed by immunohistochemistry on tissue sections. RESULTS: There were no significant demographic differences between the patients with OA with KFC and without KFC save for reduced extension in their surgical knee (p<0.01). KFC patients showed a 6.4-fold decrease in CSN1S1 (p=0.017) gene expression and a 3.7-, 2.0-, and 2.6-fold increase in CHAD, Sox9, and Cyr61 gene expression, respectively (p=0.001, 0.004, 0.001, respectively). There were corresponding increases in protein levels for chondroadherin, sex determining region Y-box 9, and casein alphaS1 (all p<0.05). Functional analysis of the differentially expressed genes indicated a strong association with pathways related to the extracellular matrix and to tissue fibrosis. CONCLUSION: Posterior capsules in endstage OA knees with KFC exhibited differential expression of 4 genes all previously documented to be associated with tissue fibrosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».