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Enregistrement W2063961339 · doi:10.1073/pnas.1113554108

Superoxide dismutase 1 (SOD1) is a target for a small molecule identified in a screen for inhibitors of the growth of lung adenocarcinoma cell lines

2011· article· en· W2063961339 sur OpenAlexfundno aff
Romel Somwar, Hediye Erdjument‐Bromage, Erik Larsson, David Shum, William W. Lockwood, Guangli Yang, Chris Sander, Ouathek Ouerfelli, Paul Tempst, Hakim Djaballah, Harold Varmus

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteVetenskapsrådetNational Institutes of HealthMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterCanadian Institutes of Health ResearchCommonwealth Foundation
Mots-clésSOD1Superoxide dismutaseCell cultureCell growthKRASEpidermal growth factor receptorBiologyMolecular biologyGrowth inhibitionCell biologyCancer researchChemistryBiochemistryGeneReceptorMutationEnzymeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously described four small molecules that reduced the growth of lung adenocarcinoma cell lines with either epidermal growth factor receptor (EGFR) or KRAS mutations in a high-throughout chemical screen. By combining affinity proteomics and gene expression analysis, we now propose superoxide dismutase 1 (SOD1) as the most likely target of one of these small molecules, referred to as lung cancer screen 1 (LCS-1). siRNAs against SOD1 slowed the growth of LCS-1 sensitive cell lines; conversely, expression of a SOD1 cDNA increased proliferation of H358 cells and reduced sensitivity of these cells to LCS-1. In addition, SOD1 enzymatic activity was inhibited in vitro by LCS-1 and two closely related analogs. These results suggest that SOD1 is an LCS-1-binding protein that may act in concert with mutant proteins, such as EGFR and KRAS, to promote cell growth, providing a therapeutic target for compounds like LCS-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,277

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations159
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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