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Enregistrement W2064014665 · doi:10.1139/b99-125

Variation in the mitochondrial DNA of the potential biological control agent <i>Chondrostereum purpureum</i>

2000· article· en· W2064014665 sur OpenAlexvenueaboutno aff
Tod D. Ramsfield, Simon F. Shamoun, Zamir K. Punja, William E. Hintz

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBiological Control of Invasive Species
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitochondrial DNABiologyGeneticsHaplotypePopulationGeneMolecular biologyCytochrome bRestriction fragment length polymorphismRestriction enzymePolymerase chain reactionGenomeRestriction siteGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mitochondrial DNA (mtDNA) of Chondrostereum purpureum (Pers.:Fr.) Pouzar was extracted and purified, and the size ranged from 51.8 to 66.4 kb. One isolate each from British Columbia, Alberta, Finland, the Netherlands, and New Zealand were found to have identical BamHI mtDNA restriction patterns, resulting in a mitochondrial genome of 63.8 kb. An additional isolate from British Columbia and one from Switzerland had different banding patterns, however, resulting in mitochondrial genomes of 66.4 kb and 51.8 kb, respectively. A sequence-characterized amplified region (SCAR) assay, based on a polymerase chain reaction, was developed to rapidly screen a larger population of 84 isolates from North America, Europe, and New Zealand. Two SCARs, one encoding the NADH 4 gene (3 kb) and the second encoding the ATPase VI and cytochrome b genes (5.1 kb), were digested with 24 restriction enzymes. There were no polymorphisms in the NADH 4 containing SCAR, while a single polymorphism was detected by NsiI in the ATPase VI - cytochrome b containing SCAR. Two mitochondrial haplotypes that were distributed throughout the sample population were thus identified. The coancestry coefficient (&lt;$Q7A0D00000010446D80BFFEFF88A524F5343905055B98C420120907B4DDA9ECB1F0&gt;) for all subpopulations of the sample population was calculated to be 0.0353. The level of gene diversity in the mtDNA ofC. purpureum suggested that the chance introduction of novel mitochondrial genes following biological control applications of the fungus is relatively low.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,949
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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