P2‐032: Three‐dimensional telomere analysis in Alzheimer's disease (AD)
Notice bibliographique
Résumé
Telomeres are linear TTAGGG repeats capping human chromosomes maintaining chromosomal integrity. Telomeres shorten progressively with each cell division and with age. The aims of our study was to analyze the three-dimensional (3D) architecture of telomeres in AD patients compared to age-matched normal controls in cells obtained from buccal swaps. 3D analysis allows for quantification of telomere numbers, length and aggregates. Buccal swaps were chosen because cells derive from the neuroectoderm from which brain tissue also originates, and they can be collected non-invasively. Twenty six patients with AD diagnosed and staged by standard procedures (mild = 14, moderate = 7, and severe = 6) and 26 cognitively normal age-matched controls were included in the study. Cells were obtained from buccal swaps using sterile Epicentre Biotechnologies swabs, smeared on VWR micro slides and frozen at -20° C. Quantitative fluorescence in situ hybridization (Q-FISH) technique was used for telomere numbers and length analysis in 30 interphase cells/person. Digital images were taken using Zeiss AxioImager Z1 with a cooled AxioCam HR B&W, DAPI, Cy3 filters in combination with a Planapo 63x/1.4 oil objective lens. Images were acquired by using AXIOVISION 4.8 (Zeiss) in multichannel mode followed by constrained iterative deconvolution. For every fluorochrome, 120 images stacks were acquired with a sampling distance of 200 nm along the z, and 102 nm in the XY axis. Quantitation of 3D nuclear telomeric signals was performed using TeloView. Differences in telomere intensity between AD patients and normal controls, were analyzed by Fisher exact test (number of telomeres) and Chi-Square (telomere length). Patients with mild to severe AD had significantly less number of telomeres and shorter telomeres than the control subjects (range from P<.001 to P<.0001). There was no difference in telomere aggregates between AD patients and controls. Smeared buccal swap cells are suitable for telomere 3D analysis in AD and normal controls. Subjects with AD, at any stage of the disease had less and shorter telomeres in their buccal cells when compared to their age-matched controls. No differences in aggregates distinguish the findings from the ones in cancer patients. Validation in a larger sample is warranted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».