Photoaffinity Cross-Linking of the Corticotropin-Releasing Factor Receptor Type 1 with Photoreactive Urocortin Analogues
Notice bibliographique
Résumé
Interaction of natural peptide ligands with class 2 GPCRs, which are targets of biologically important hormones such as glucagon, secretin, and corticotropin-releasing factor (CRF), occurs with a common orientation, in that the ligand C-terminus binds to the extracellular receptor N-terminus, whereas the ligand N-terminus binds to the receptor juxtamembrane domain. N-Terminal truncation, by eight amino acids in the case of CRF, leads to antagonists, suggesting those residues constitute the receptor activating sequence. Here, we identified by photoaffinity cross-linking using p-benzoyl-l-phenylalanine (Bpa) analogues of urocortin (Ucn) the most affine CRF receptor agonist, interaction domains of CRF(1) receptor with Bpa residues at exclusive positions. Specific cleavage patterns of the corresponding ligand-receptor complexes, obtained using several cleavage methods in combination with SDS-PAGE for fragment size determination, showed that a Bpa group located N-terminally or in position 12 binds at the second and such in position 17 or 22 at the first extracellular receptor loop. Our results indicate that the very N-terminal ligand residues (1-11), which are responsible for receptor activation, are oriented to the juxtamembrane domain by interaction of amino acid residues 12, 17, and 22. Our findings contradict a recently proposed interaction model derived from ligand interaction with a soluble receptor N-terminus, indicating that conclusions drawn from such a reduced system may be of limited value to understand the interaction with the full-length receptor.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».