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Enregistrement W2064083647 · doi:10.1158/0008-5472.sabcs12-p1-05-20

Abstract P1-05-20: Fluorescent Hyaluronan Probes Distinguish Heterogeneous Breast Cancer Cell Subsets and Predict their Invasive Behavior

2012· article· en· W2064083647 sur OpenAlexaff
Mandana Veiseh, DH Kwon, AD Borowsky, Cornelia Toelg, Hon Leong, Jill B. Lewis, EA Turley, MJ Bissell

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCD44BiologyReceptorCellCell culturePhenotypeMolecular biologyFlow cytometryCancer cellCancer researchCytoplasmCell sortingChemistryCancerCell biologyBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Tumor heterogeneity is a determining factor in diagnosis and therapy of breast cancer (Bca). We investigated Bca cellular heterogeneity by a functional fluorescent hyaluronan (HA) probe, and monitored its binding characteristics in relation to the degree of Bca aggression. HA is a polysaccharide ligand for CD44 and RHAMM receptors, which are linked to cell plasticity and predict poor clinical outcome in Bca. Methods: Fluorescent HA probes, multiplexed profiling, and cell sorting strategies were developed and used to detect/capture tumor cell subpopulations with differences in HA binding (HA−/low vs. HAhigh) and HA receptors surface display. Whereas we concentrated on the most metastatic cell line, MDA-MB-231, we also monitored the presence of subpopulations in other Bca lines and showed heterogeneity in all. Results: The HA probe binding was highly heterogeneous, and the highest binding level was detected in highly invasive triple-negative basal subtypes such as MDA-MB-231. HA probes bound to the cell surface but also accumulated in cytoplasm and nucleus. Binding levels were dramatically reduced upon ‘reversion’ of highly malignant cells to a non-malignant phenotype in three-dimensional cultures, suggesting that the level of cellular binding to fluorescent HA probe provides a measure of malignant behavior. Comparison between HAhigh and HA−/low subpopulations revealed surprising differences in morphology, proliferation and invasion in culture, which were retained in two in vivo models. HAhigh subpopulations exhibited higher levels of invasion but surprisingly lower levels of proliferation compared to either unsorted parental cells or the HA−/low subpopulation. Conclusions: Querying HA binding in Bca lines reveals an unexpected heterogeneity with respect to tumor phenotype in vivo, morphology in 3D, invasion and proliferation. These results may aid in diagnosis and therapy of invasive Bca subpopulations and early sorting of cancer patients needing intensive chemotherapy. Keywords: Heterogeneity, 3D cultures, Hyaluronan, CD44, RHAMM/HMMR, Tumor phenotype, Breast cancer, Invasion. Citation Information: Cancer Res 2012;72(24 Suppl):Abstract nr P1-05-20.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
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