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Enregistrement W2064223801 · doi:10.1002/humu.21655

Oligomerization of SLC4A11 protein and the severity of FECD and CHED2 corneal dystrophies caused by<i>SLC4A11</i>mutations

2011· article· en· W2064223801 sur OpenAlexafffund
Gonzalo L. Vilas, Sampath K. Loganathan, Anita Quon, Periasamy Sundaresan, Eranga N. Vithana, Joseph R. Casey

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBiomedical Research and Pathophysiology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMissense mutationMutantBiologyMutant proteinCell biologyHEK 293 cellsMutationGeneticsMolecular biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the SLC4A11 gene, which encodes a plasma membrane borate transporter, cause recessive congenital hereditary endothelial corneal dystrophy type 2 (CHED2), corneal dystrophy and perceptive deafness (Harboyan syndrome), and dominant late-onset Fuchs endothelial corneal dystrophy (FECD). We analyzed missense SLC4A11 mutations identified in FECD and CHED2 patients and expressed in transfected HEK 293 cells. Chemical cross-linking and migration in nondenaturing gels showed that SLC4A11 exists as a dimer. Furthermore, co-immunoprecipitation of epitope-tagged proteins revealed heteromeric interactions between wild-type (WT) and mutant SLC4A11 proteins. When expressed alone, FECD- and CHED2-causing mutant SLC4A11 proteins are primarily retained intracellularly. Co-expression with WT SLC4A11 partially rescued the cell surface trafficking of CHED2 mutants, but not FECD mutants. CHED2 alleles of SLC4A11 did not affect cell surface processing of WT SLC4A11. In contrast, FECD mutants reduced WT cell surface processing efficiency, consistent with dominant inheritance of FECD. The reduction in movement of WT protein to the cell surface caused by FECD SLC4A11 helps to explain the dominant inheritance of this disorder. Similarly, the failure of CHED2 mutant SLC4A11 to affect the processing of WT protein, explains the lack of symptoms found in CHED2 carriers and the recessive inheritance of the disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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