Profiling target genes of FGF18 in the postnatal mouse lung: possible relevance for alveolar development
Notice bibliographique
Résumé
Better understanding alveolarization mechanisms could help improve prevention and treatment of diseases characterized by reduced alveolar number. Although signaling through fibroblast growth factor (FGF) receptors is essential for alveolarization, involved ligands are unidentified. FGF18, the expression of which peaks coincidentally with alveolar septation, is likely to be involved. Herein, a mouse model with inducible, lung-targeted FGF18 transgene was used to advance the onset of FGF18 expression peak, and genome-wide expression changes were determined by comparison with littermate controls. Quantitative RT-PCR was used to confirm expression changes of selected up- and downregulated genes and to determine their expression profiles in the course of lung postnatal development. This allowed identifying so-far unknown target genes of the factor, among which a number are known to be involved in alveolarization. The major target was adrenomedullin, a promoter of lung angiogenesis and alveolar development, whose transcript was increased 6.9-fold. Other genes involved in angiogenesis presented marked expression increases, including Wnt2 and cullin2. Although it appeared to favor cell migration notably through enhanced expression of Snai1/2, FGF18 also induced various changes consistent with prevention of epithelial-mesenchymal transition. Together with antifibrotic effects driven by induction of E prostanoid receptor 2 and repression of numerous myofibroblast markers, this could prevent alveolar septation-driving mechanisms from becoming excessive and deleterious. Last, FGF18 up- or downregulated genes of extracellular matrix components and epithelial cell markers previously shown to be up- or downregulated during alveolarization. These findings therefore argue for an involvement of FGF18 in the control of various developmental events during the alveolar stage.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».