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Enregistrement W2064308123 · doi:10.1074/jbc.m110.179150

Temperature and Mg2+ Sensing by a Novel PhoP-PhoQ Two-component System for Regulation of Virulence in Edwardsiella tarda

2010· article· en· W2064308123 sur OpenAlexaff
Smarajit Chakraborty, Mo Li, Chiradip Chatterjee, J. Sivaraman, Ka Yin Leung, Yu‐Keung Mok

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensTrinity Western UniversityWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEdwardsiella tardaVirulenceSecretionChemistryBacteriaMicrobiologyBiochemistryBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The PhoP-PhoQ two-component system is commonly used by bacteria to sense environmental factors. Here we show that the PhoP-PhoQ system of Edwardsiella tarda detects changes in environmental temperature and Mg(2+) concentration as well as regulates the type III and VI secretion systems through direct activation of esrB. Protein secretion is activated from 23 to 35 °C or at low Mg(2+) concentrations, but it is suppressed at or below 20 °C, at or above 37 °C, or at high Mg(2+) concentrations. The effects of temperature and Mg(2+) concentration are additive. The PhoQ sensor domain has a low T(m) of 37.9 °C, and it detects temperatures through a conformational change of its secondary structure. Mutation of specific Pro or Thr residues increased the stability of the PhoQ sensor drastically, altering its temperature-sensing ability. The PhoQ sensor detects Mg(2+) concentration through the direct binding of Mg(2+) to a cluster of acidic residues (DDDSAD) and through changes that likely affect its tertiary structure. Here, we describe for the first time the use of PhoP-PhoQ as a temperature sensor for bacterial virulence control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,365

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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