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Enregistrement W2064335603 · doi:10.1152/physiolgenomics.00070.2012

Functional genomics of the rat neuromedin U receptor 1 reveals a naturally occurring deleterious allele

2012· article· en· W2064335603 sur OpenAlexaff
Rosemarie Panetta, Luc Meury, Chang Cao, Carole Puma, Françoise Mennicken, Paul A. Cassar, Jennifer M.A. Laird, Thierry Groblewski

Notice bibliographique

RevuePhysiological Genomics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensMcGill UniversityAstraZeneca (Canada)
Organismes subventionnairesPharmaronAstraZeneca
Mots-clésBiologyReceptorSingle-nucleotide polymorphismFunctional genomicsAlleleG protein-coupled receptorPopulationExonGeneticsGeneGenomicsGenotypeGenomeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neuromedin U (NMU) plays an important role in a number of physiological processes, but the relative contribution of its two known receptors, NMUR1 and NMUR2, is still poorly understood. Here we report the existence of a SNP T(1022)→A (Val(341)→Glu) in the third exon of the rat Nmur1 gene that leads to an inactive receptor. This SNP is present within the coding region of the highly conserved NPXXY motif found within all class A type G protein-coupled receptors and translates to an NMUR1 receptor that is not expressed on the cell surface. Genetic analysis of the Nmur1 gene in a population of Sprague-Dawley rats revealed that this strain is highly heterogeneous for the inactivating polymorphism. The loss of functional NMUR1 receptors in Sprague-Dawley rats homozygous for the inactive allele was confirmed by radioligand binding studies on native tissue expressing NMUR1. The physiological relevance of this functional genomics finding was examined in two nociceptive response models. The pronociceptive effects of NMU were abolished in rats lacking functional NMUR1 receptors. The existence of naturally occurring NMUR1-deficient rats provides a novel and powerful tool to investigate the physiological role of NMU and its receptors. Furthermore, it highlights the importance of verifying the NMUR1 single nucleotide polymorphism status for rats used in physiological, pharmacological or toxicological studies conducted with NMUR1 modulators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,487

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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