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Enregistrement W2064368782 · doi:10.1094/pdis-03-12-0309-pdn

First Report of the Root-Lesion Nematode, <i>Pratylenchus alleni</i> Associated with Damage on Soybean in Quebec, Canada

2012· article· en· W2064368782 sur OpenAlexaffabout
G. Bélair, Benjamin Mimee, Marc‐Olivier Duceppe, Stephen E. Miller

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensCanadian Food Inspection AgencyAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPratylenchusLoamAgronomyHorticultureCultivarHeteroderaNematodeSoil waterEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In eastern Canada, soybean, Glycine max (L.) Merr., is the most important cultivated legume species. In 2011, the provinces of Ontario and Quebec had 987,400 and 300,000 ha of soybean production, respectively. Root-lesion nematodes, Pratylenchus spp., are the most prevalent plant-parasitic nematodes in Canadian agroecosystems and can affect many crops (3). In 2011, irregular patches of stunted soybean plants were observed for the first time in a 10-ha soybean field grown on a light texture soil in St. Anicet, Quebec (45°4'50.51″N, 74°21'18.56″W). Yield reduction in damaged plots ranged from 38 to 54% when compared with asymptomatic adjacent plots. The field was sown with soybean cv. PRO 2715R (PRO Seeds of Canada, Woodstock, ON), a Roundup Ready cultivar of 2,750 CHU, at 100 kg/ha. Soil analysis revealed a uniform pH of 6.0 ± 0.2 on a gravelly sandy soil (81% sand, 10% loam, 9% clay, and 4% organic matter). On 7 October 2011, root samples were collected from 10 randomly selected damaged patches, washed under running water, and deposited in a mist chamber for a 14-day extraction period. Specimens were stored in tap water at 4°C before identification. Based on morphological characteristics, 26 individual specimens were examined (14 females, 11 males, one juvenile) and were all identified as Pratylenchus alleni Ferris, 1961 (2). Genomic DNA was extracted from individual larvae and the internal transcribed spacers (ITS) region was amplified. RFLP analysis with five restriction enzymes (CfoI, DdeI, HindIII, HpaII, and PstI) showed that the banding pattern for this species was different from those of 18 other major Pratylenchus species (4). Sequence of ITS regions of this population (GenBank Accession No. JX081545) confirmed genus identification but showed only limited homology (<85%) with the 20 Pratylenchus species available in the database at this time. Based on the morphological identification and the ITS sequence divergence with other important species, the sequence was deposited as the first P. alleni accession in GenBank. In the United States, the pathogenicity of P. alleni to soybean is well established (1). To our knowledge, this is the first report of P. alleni occurrence and damage to soybean in Canada. The outbreak of this root-lesion nematode will pose a new challenge for crop management since no registered compounds are currently available against this pest in soybean in Canada. References: (1) N. Acosta and R. B. Malek. J. Nematol. 13:6, 1981. (2) V. Ferris. Proc. Helminthological Soc. Washington 28:109, 1961. (3) J. W. Potter and A. W. McKeown. Can. J. Soil Sci. 83:289, 2003. (4) L. Waeyenberge et al. Nematol. 2:135, 2000.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,095

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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